PD Dr. Arijit Biswas
Structural biochemistry and cheminformatic group
Der Schwerpunkt unserer Arbeitsgruppe liegt auf der Charakterisierung der genetischen, strukturellen und funktionellen Aspekte von Gerinnungsproteinen mithilfe einer Vielzahl biochemischer und computergestützter Methoden. Unser Hauptinteresse gilt dem Gerinnungsfaktor XIII (FXIII), einem im Plasma zirkulierenden Pro-Transglutaminase-Komplex, der für die kovalente Quervernetzung des bereits gebildeten, löslichen Fibringerinnsels verantwortlich ist und dieses in ein unlösliches, gegen vorzeitige Fibrinolyse resistentes Gerinnsel umwandelt. Ein angeborener Mangel an Faktor XIII ist eine seltene Gerinnungsstörung, die zu einer ausgeprägten Blutungsneigung führt. Die schwere Form des FXIII-Mangels wird durch homozygote oder compound-heterozygote Mutationen in den FXIII-Genen verursacht. Untersuchungen unserer Gruppe deuten zudem auf das Vorliegen einer milden Form des FXIII-Mangels hin, die ausschließlich durch heterozygote genetische Varianten entsteht. Mithilfe eines kombinierten Ansatzes aus in silico-Modellierung und biochemischen Analysen konnten wir unter anderem Einblicke in den Aktivierungsmechanismus von FXIII, die Rolle der Calcium-Bindung, die regulatorische Bedeutung der FXIIIB-Untereinheit sowie deren genetische Variabilität gewinnen. Kürzlich konnte unsere Gruppe mithilfe eines integrativen Hybridansatzes das erste vollständige Atommodell des plasmatischen FXIII-Komplexes erstellen.
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